Вы совершенно правы - ВСЕ породы микродефектны! Это лежит в основе многих их (и не только пород) свойств: масштабный эффект, неоднородность, анизотропия, прочность, деформируемость и т.д. Поэтому если мы хотим не только понимать, но и практически использовать эти понятия - надо следовать лозунгу "ЗРИ В КОРЕНЬ"!
Но и проще, как вы верно заметили, - тоже можно! Например, шагнуть на 100 лет назад и пользоваться коэффициентом крепости М.М. Протодьяконова. Только уровень техники и технологии тоже должен быть на век моложе и примитивнее.

Все породы имеют трещины. Значит - они микродефектны? Чтой-то больно сложно! А если упростить задачу, то к большим ошибкам приведет? Короче, насколько это нужно для будущего?